Die Mail-Ordner liegen unter dem Pfad "C:\Dokumente und Einstellungen\Benutzername\Anwendungsdaten\Thunderbird\Profiles
\xxxxxx.default\Mail\Local Folders"
Wenn du für das Konto nicht den lokalen Posteingang verwendest, dann liegen die Mails in einem entsprechenden Unterordner.
Die liegen die Dateien "Inbox", "Sent", "Drafts", etc...