Ok., also FAT32 kann rechnerisch 2TB adressieren. Problem dabei, schon ab 32GB steigt die Clustergrösse - Auswirkung Du hast bei sehr vielen kleinen Dateien, oder vielen Dateien mit krummer Endung verdammt viel Platz der ungenutzt rumdümpelt, weil für jede Datei immer ganze Cluster reserviert werden, auch wen sie nicht voll genutzt werden.
Weiteres Problem, was bei dir zutreffen könnte, die Erkennung der Festplattengrösse ist nicht nur abhängig vom Betriebssystem, sondern auch von den verbauten Controllern und dem BIOS des Mainboards (vor einigen Jahren war das 128GB Problem recht bekannt). Möglich also, das es gar nicht am OS liegt, sondern am BIOS, bzw. Chips.
Ich würde daher die Festplatte einfach in Partitionen aufteilen, legst halt für das OS + Programme + Spiele eine Partition an und für die "eigenen Dateien" eine andere, beide so 40 GB - schon sollte das Adressierungsproblem gegessen sein.