Spielt man die Renegade-Variante und kollaboriert mit der Dallatrass, bleibt einem keine andere Möglichkeit, als Mordin zu erschießen, um die Sabotage am 'Mantel' zu vertuschen - was aber das Problem mit sich bringt, dass die Kroganer dies herausfinden und ihr Anführer (egal ob Wrex oder Wreav) folglich Vergeltung an Shepard üben will.
In der Paragon-Variante kann man nur versuchen ihn davon abzuhalten, aber Mordin lässt sich unter keinen Umständen davon abbringen und findet folglich stattdessen bei der Explosion des Turms sein Ende - angesichts seiner erwachsenen Gewissensbisse hinsichtlich seiner Arbeit ein dennoch versöhnlicher und storytechnisch fast schon angebrachter Tod, wenn er am Ende, mit sich selbst wieder im Reinen, stirbt.
Mordin is also einer von drei ME2-Charakteren, deren Tod sich in ME3 (sofern sie überhaupt im Vorgänger das Selbstmordkommando überlebt hatten), nicht abwenden lässt.